Ów zwierzęta poznajemy w nowojorskim ZOO, gdzie całe życie spędziły w błogiej niewoli, zajadając się smakołykami i rozkoszując się widokami parku.
Ich kłopoty rozpoczynają się wraz z ucieczka Marty, która chce zaspokoić swoją ciekawość o prawdziwym świecie i z pomocą genialnych pingwinów ucieka z zoo.
Konsekwencje tego czynu dla pozostałych zwierząt są straszne, ponieważ zostają wsadzone na statek płynący do Afryki, którego stery przejmują pingwiny, a czwórka naszych bohaterów ląduje na dzikiej wyspie Madagaskar.
Jednak to nie koniec ich problemów, ponieważ na tej egzotycznej wyspie czyha na nich wiele niebezpieczeństw i spotkanie z tubylcami….

Film ten nie tylko opowiada o przygodach czwórki zwierząt, ale także o wielkiej przyjaźni pomiędzy nimi.
Przyjaźni, która pozwala przetrwać im najtrudniejsze chwile.